SP3（单锅固相增强样品制备）蛋白质组学是一种高效、简便且高度自动化的蛋白质样品制备技术，近年来在质谱分析领域得到了广泛应用。传统蛋白质组学样品制备方法通常涉及复杂的蛋白抽提、变性、还原、烷基化、酶解和肽段纯化等多个步骤，不仅繁琐耗时，还容易导致蛋白损失、污染和可重复性问题。而SP3（单锅固相增强样

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癌细胞依赖性图谱（DepMap）蛋白质组学是一种结合大规模基因组学和蛋白质组学数据以揭示癌细胞存活所必需基因和蛋白质的新兴研究领域。癌细胞的生存与增殖高度依赖特定的基因与蛋白质，这些依赖性可以作为潜在的治疗靶点。DepMap研究通过CRISPR或RNAi基因敲除技术，筛选出不同癌症类型的关键依赖基因

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大肠杆菌（E. coli）宿主细胞蛋白测定是指在重组蛋白生产过程中对大肠杆菌表达系统中残留的非目标蛋白（即宿主细胞来源的杂蛋白）进行定性和定量检测的关键分析步骤。这一过程对确保生物制品安全性、纯度和一致性具有重要意义。在生物药物开发、疫苗生产以及其他重组蛋白制备环节中，大肠杆菌因其遗传背景清晰、生长

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单细胞通路分析是一种通过对单个细胞的高通量数据进行解析，揭示细胞内分子信号传递和生物学过程的技术。与传统的群体细胞分析方法不同，单细胞技术能够深入挖掘细胞在异质性、个体差异和状态变迁等方面的独特信息，尤其在揭示细胞内复杂信号通路和生物学通路的调控机制上具有独特优势。通路分析指的是通过解析一组功能相关

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表达蛋白质组学分析是蛋白质组学的分支，它专注于研究细胞、组织或体液中蛋白质的表达水平及其动态变化。通过定量分析不同生理或病理状态下的蛋白质表达谱，表达蛋白质组学分析在疾病机制研究、药物开发、生物标志物筛选及精准医学等领域发挥作用。与基因组学相比，表达蛋白质组学分析更能直接反映生物体的功能状态，因为蛋

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消减蛋白质组学/减法蛋白质组学是指通过特定的技术手段从复杂的生物样本中去除或减少干扰成分，聚焦于特定目标蛋白或蛋白质组，从而提高分析效率和准确性的一种研究方法。相较于传统的整体蛋白质组学分析，消减蛋白质组学/减法蛋白质组学通过“减法”策略去除不相关的蛋白质或背景干扰，使得研究

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BioID 与 TurboID是主要用于研究细胞内蛋白质相互作用网络的生物化学技术。这两项技术通过标记紧邻或与特定靶蛋白相互作用的蛋白质，帮助研究者绘制出细胞内复杂的蛋白质相互作用图谱。BioID是生物邻近标记技术 (Biotin Identification) 的缩写，它利用一种突变的生物素连接酶

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亲和纯化质谱蛋白质相互作用分析是一种蛋白质组学技术，它广泛用于研究细胞内的蛋白质互作网络。该方法结合了亲和纯化和质谱分析，通过特异性亲和捕获目标蛋白及其相互作用蛋白，再利用高分辨率质谱仪进行鉴定和定量分析，从而系统性地揭示蛋白质复合物的组成及其生物学功能。蛋白质之间的相互作用对于生命活动至关重要，涉

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定量蛋白质组学（Quantitative Proteomics）研究蛋白质表达水平及其动态变化，广泛应用于生命科学、医学研究和生物制药等领域。通过对生物系统（如细胞、组织、体液或生物体）的蛋白质进行系统定量分析，研究人员可以解析蛋白质在不同条件下的变化，从而揭示生物学机制、疾病发生发展及药物作用的潜

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蛋白从头测序（De Novo Sequencing）是一种无需参考基因组或数据库，直接解析蛋白质一级结构（氨基酸序列）的技术。该方法对于研究未知蛋白、抗体药物开发、非模式生物的蛋白组学分析，以及蛋白翻译后修饰（PTMs）的研究具有重要意义。传统的蛋白质测序依赖于基因组数据或已知蛋白质数据库的比对，但

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