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连锁分析芯片是进行疾病连锁分析的最佳工具，可以从家系基因型表现型和单基因型连锁不平衡中发现连锁关系。人类连锁分析芯片实验表明其成功率为99.8%，重复性>99.9%。

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了解编码药物代谢酶和药物转运蛋白的基因中的常见变异，能预测个体的遗传变异对代谢能力的影响，从而有可能大大有利于临床研究。

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人染色体CGH芯片4号染色体,人CGH染色体芯片Human CGH 385K Chromosome 4 Tiling Array 

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大鼠甲基化芯片2.1M经济型,大鼠全基因组甲基化芯片Rat DNA Methylation 2.1M Economy Whole-Genome Tiling - 4 Array SetForm

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棉花全基因组表达谱芯片所用的序列信息来自于RefSeq, UniGene, TIGR Plant TA 和TIGR Gene Indices等知名数据库，代表了43,803个棉花基因和转录本。

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人染色体CGH芯片22号染色体,人CGH染色体芯片Human CGH 385K Chromosome 22 Tiling Array 

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